史序凡例卷一风暑湿燥温热卷二咽喉耳目口齿咳嗽咳血喘胸痹虚劳不寐心悸健忘卷三肝风呕吐噎格脘痛腹痛泄泻痢疟卷四肿胀遗精遗尿淋浊疝气疮疡调经带下胎前产后
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
中医蒙求
医垒元戎
序叙论痈疽发背第一服药通变方第二荣卫返魂汤用敷贴温药第三冲和仙膏敷贴热药第四回阳玉龙膏敷贴凉药第五洪宝丹合用诸方第六黄矾丸柞木饮子三石散栝蒌散真君妙贴散追风丸搜损寻痛丸复煎散神锋散乌金散索血散葛根汤散
医家小传伤风伤风转少阳证伤风转结胸证伤风汗多阳虚证伤寒夏令伤寒证（一）夏令伤寒证（二）冬令伤寒证冬令伤寒液少证湿温湿温化燥证产后湿温化燥证湿温肠出血证湿温夹食重证热病热病夹食重证热病神昏发厥证阳明热病
通俗序壶天性果女丹十则（一卷）第一则·养真化气第二则·九转炼形第三则·运用火符第四则·默运胎息第五则·广立功行第六则·志坚行持第七则·调养元神第八则·移神出壳第九则·待度飞升第十则·了道成真女金丹序上
简介序卷上人法于天地论第一阴阳大要调神论第二生成论第三阳厥论第四阴厥论第五阴阳否格论第六寒热论第七虚实大要论第八上下不宁论第九脉要论第十五色[一作绝]脉论第十一脉病外内证决论第十二生死要论第十三病有灾
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
叙卷上诊法常以平旦望色常宜定静明堂周身部位明堂六部提纲面貌分应脏腑五官分应五脏五色分应五脏相气十法提纲望法阴阳总纲五色相应提纲五色主病提纲部色主病提纲四时望法相参四时气色主病昼夜阴晴相参五方望法相参气