卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论
自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
巢氏诸病源候总论
第1部分第2部分第3部分第4部分
诸病主病诗
原序卷之一一·条令二·检覆总说上三·检覆总说下四·疑难杂说上卷之二五·疑难杂说下六·初检七·覆检八·验尸九·妇人附·小儿尸并胞胎十·四时变动十一·洗罨十二·验未埋瘗尸首十三·验坟内及屋下攒殡尸十四·验
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
经症十八问胎前三十四问产后三十四问杂症四十三问
王序卷一四明心法（上）诊法脉义二十五方总图二十五方分图二十五方图解二十五方主症卷二四明心法（中）方论药论卷三四明心法（下）中风伤寒疟疾痢疾鼓症膈症吞酸眩晕咳嗽怔忡血症弱症消症霍乱胃脘痛胎前产后带下淋症
原序附刊丹方补遗序自序凡例贸药辨真假诸症歌诀单方经验丹方汇编中风预防中风风气痛（附痿症、脱颏）虚劳血证肿胀反胃噎膈痰饮咳嗽梦遗白浊伤寒瘟疫（附冒风寒方）疟疾痢疾肠风下血便血淋漓并小便闭塞霍乱吐泻（附痧