序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
序一序二自序跋凡例太极图（图缺）命门水火图（图缺）五气图（图缺）卷之一医论命门水火图说五气图说论膀胱者州都之官津液藏焉气化则能出矣论补脾补肾治血贵静广嗣方论论诸痿胃气当察辨利痢脉病之殊治病求本驳诸家痨
仁端录
明堂灸经
医经读
简介1、本草分经2、海药本草3、神农本草经百种录4、食鉴本草5、吴普本草
卷一安胎论辨胎歌养胎安胎小产卷二恶阻胎痛胎漏跌扑伤胎毒药伤胎胎动满闷子肿子气卷三子悬子烦子痫子淋淋闭溺血遗尿转胞中风中恶眩晕卷四心痛心腹痛小腹痛腰腹背痛子鸣积聚咳嗽霍乱不语泄泻痢疟疾烦渴热病胎蒸吐衄爽
题辞卷上脏腑经络先后病脉证第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满
自叙序凡例卷之一先天脉镜叙先天脉镜论云诊脉捷要歌照脉玄窍诀照脉口诀三焦照六腑脾照五脏十八脉形歌五运体性六气合来为邪脉左手太过脉右手太过脉左手不及脉诀右手不及脉诀调摄养生却妄远色贵达调息除烦节食慎劳酌饮
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻